如何利用图书馆资源科学地认识新型冠状病毒
发布时间: 2020-02-17      浏览次数: 10

 

科技是战胜疫病的利器。对于广大科研工作者来说,加强科技攻关,早日把病毒研究透彻,早一点找到病毒克星,才不负国家和人民的重托。疫情发生以来,以钟南山院士等为代表的一大批医学科研工作者挺身而出,按照“战时状态”推进科研攻关,及时公布科研成果,极大增强了公众抗击疫情的信心。科技部有关方面负责人215日声明:在救治过程当中,对救治经验进行记录,进行总结,形成报告论文也是必要的;并强调,把论文写在疫情第一线,把研究成果运用到战胜疫情之中

读者如何利用好图书馆文献资源,做好疫情相关的海量的文献梳理,在这些文献当中找出值得精读、细读的关键文献,挖掘学科前沿,找到研究热点就成为了开展研究之前首先需要解决的问题。CiteSpace作为一款优秀的文献计量学软件,能够将文献之间的关系以科学知识图谱的方式可视化的展现在操作者面前,既能帮助用户梳理过去的研究轨迹,也能使得他们对未来的研究前景有一个大概的认识。

 

1.Citespace简介

Citespace是一款基于Java语言开发的引文可视化分析软件,它能帮助我们挖掘到热门主题、关键性文献,分析出某领域的发展历程。其灵感来源于库恩的《科学革命的结构》科学研究的重点随着时间变化有时比较迟缓,有时比较剧烈。由于是通过可视化的手段呈现科学知识的结构、规律和分布情况,因此最后得到的可视化图形被称为科学知识图谱

读者可以通过以下参考资料进一步了解Citespace

  • 中文博客-陈超美教授:http://blog.sciencenet.cn/u/ChaomeiChen

  • 学术主页-陈超美教授:http://www.pages.drexel.edu/~cc345/

 

2.Citespace下载与安装

主要分为两个步骤,java环境的安装和citespace软件的安装,citespace是需要java环境的,所以必须要先安装java。可以只是JRE,也可以是JDK,这两个的区别是JDK是开发工具,包含JREJREjava的一个环境。如果有java,可以直接安装citespace,如果没有的话,需要编程的同学可以安装JDK,只是想使用citespace这个软件的话安一个JRE就可以了,还不用配置环境,安装JDK是需要配置环境变量的。还要注意一点就是java环境的版本一定要与citespace要求的版本相一致。

安装完java环境之后,检查一下是否安装成功,在开始栏的搜索里输入cmd,然后进入doc环境,输入javac,如果能够出来一长串的提示,那基本就是安装成功了。然后安装citespacecitesspace的下载地址为https://sourceforge.net/projects/citespace//下载的文件CiteSpace.5.6.R2.exe,直接双击运行。

然后弹出来一个框,点击agree同意,就可以进入citespace页面了。但是要注意的是,citespace运行时,会有一个窗口伴随弹出,请勿关闭这个小黑窗,否则程序就会随之关闭。

 

3.数据准备

使用CiteSpace分析某一主题的研究历史与研究前沿,第一步就是要从文献数据库上下载到一定数量的文献信息。外文文献信息一般在web of scienceWoS)上下载得到,中文文献信息一般在中国知网(CNKI)上下载。CiteSpace是基于WoS的数据格式进行开发的,可以根据下载得到的数据进行合作网络分析、共现分析和共被引分析,在非WoS数据库下载得到的数据都需要先转化为WoS的数据格式,根据相应数据库的数据维度各有其相对应的适用范围。就数据库的深度看,外文数据库我们一般使用WoS,中文数据库一般使用CNKI

WoS关键词“新型冠状病毒”为例,键入其英文“Novel coronavirus”,数据库选择“Web of Science核心合集,检索类型选择主题,时间跨度选择所有年份。我所在的学校购买到的数据库是从1986年开始的,时间跨度可能对有些朋友而言不够长。当前国内购买WoS数据库跨度最长的机构是中科院文献情报中心,是从20世纪初期就开始的,有需要的朋友可以到那里进行数据下载。

得到如下页面。从页面中可以看出,该主题词下的索引结果有1741条。然后选择“导出”→“其他文件格式”。

选择保存为其他文件格式需要多次,第一次导出第1到第500条记录,第2次导出第5011000条记录……最后一次15001741条记录。因为WoS每一次最多允许导出500条文献记录,记录内容为全纪录与引用的参考文献,文件格式为“纯文本”。

然后在本地计算机中,新建一个project文件夹,并建立子文件夹data,将之前导出的4个文件保存至data中,并以download_*.txt命名,其中*代表数字。

 

 

4.数据处理

进入citespace后,点击“new”新建一个项目。

项目名称、项目文件将、数据文件夹的设置如下图,设置完成点击“save”。具体的参数设置,可以参阅“1.Citespace”简介中的博客,一般选择默认参数即可。

建立好项目,就可以“GO!”了,运行完成后会弹出一个窗口,选择“Visualize”。

得到需要的文献可视化图谱。主窗口包含功能菜单和图谱,右侧小窗用来美化图谱。

 

5.图谱的使用

颜色的冷暖代表了时间的远近,颜色越暖,时间越近;颜色越冷,时代越久远。那么通过对网络进行分析,对其中关键节点(即关键文献)进行研究,就可以知道,支撑支撑新型冠状病毒发展的知识基础在时间上的发展演进情况。那么用户需要研究哪一个阶段的新型冠状病毒历史,就得找到相应时段的文献进行研读、浏览和整理。

对这个结果网络进行聚类分析,可以看到各个阶段知识基础的主题的变化情况,方便我们进行主题聚焦。从文献的引证关系和节点的重要性上,发现那些研究也许相对重要,以此个为出发点展开研究,深度阅读文献。

此外,Citespace的功能相当丰富,由于篇幅的关系,鼓励读者独立进行探索。下面提供一些图书馆的相关资源,帮助大家更好的理解CiteSpace的使用。

 

  • 免费的图书资源,可以参考李杰的CiteSpace中文版指南:http://cluster.ischool.drexel.edu/~cchen/citespace/manual/CiteSpaceChinese.pdf.

  • 我馆馆藏图书:《引文空间分析原理与应用:CiteSpace实用指南》,G353.1-64/7409,陈悦等着,科学出版社,2014

  • 我馆馆藏图书:《citespace:科技文本挖掘及可视化.2版》,TP31/4004.3(2),李杰, 陈超美着,首都经济贸易大学出版社,2017