学院于2006年获得马克思主义基本原理、思想政治教育2个二级学科硕士学位点授予权。2018年获批马克思主义理论一级学科硕士点授予权。马克思主义理论一级学科下设马克思主义基本原理、马克思主义中国化研究、国外马克思主义研究、思想政治教育研究等4个研究方向。另设马克思主义中国化与新时代上海发展研究中心、西方马克思主义与中国马克思主义比较研究中心、马克思主义科学方法论与现代科技发展研究所、中国近现代国情研究所、政治与法治教育研究所共5个研究机构。