上海理工大学环境科学与工程系（原环境工程系）建于1997年4月，现有专职教师43名，其中正教授6名、副教授16名，具有博士学位（含在读博士）的教师37名，24人具有海外留学的经历。本专业教师获得浦江人才、上海青年东方学者、曙光人才、晨光计划和扬帆计划等多个人才项目支持。国家千人计划入选者1人。

环境科学与工程系于1997年开始招收环境工程专业本科生，2004年开始招收环境工程专业工学硕士研究生，2007年开始招收环境科学与工程专业工学硕士研究生，2010年开始招收能源与环境工程专业工学博士研究生，2009年开始招收环境工程工程领域专业硕士研究生。自2011年到2016年本科生就业率每年95%以上，研究生的就业率100%。

该系现拥有上海市教委重点实验室“环境科学与工程重点实验室”1个，上海市高校环境工程教育高地平台1个，上海市青少年创新人才培养基地：上海理工大学环境科学实践工作站1个。实验中心面积约为2000 平方米，实验仪器、实验装置和专业软件等价值达3000 余万。

现有能源与环境工程博士点1个，环境科学与工程一级学科硕士点1个，环境工程、环境科学硕士点2个，工程领域专业硕士点1个，环境工程本科专业点1个。近三年获得20 余项国家自然科学基金和863 项目，各类研究经费达3100 余万。发表论文250 余篇，其中ESI 高被引论文5 篇，国际重要刊物SCI论文90 多篇并获得多次引用。该学科与美国、加拿大、瑞典、日本和韩国多所大学具有长期合作关系，近三年3 名教师赴美国、加拿大和欧盟进行合作研究。该系曾荣获国家级科技奖2项，省部科技奖7项。

由于本系教师在教学、科研方面的突出表现，上海理工大学环境科学与工程系教学科研团队于2012年4月荣获“上海市青年五四奖章集体”称号。2016年3月获得上海市“巾帼文明岗”称号。