管理学院前身为我国最早成立的系统工程系和系统工程研究所（1979年），1999年5月更名为管理学院，2006年1月与商学院、MBA教育管理中心重组成立新的管理学院（Business School）。2018年5月通过AACSB（The Association to Advance Collegiate Schools of Business）国际认证，成为中国大陆地区第20所、上海市第6所通过AACSB国际认证的大学。

目前学院拥有教职工220余名、博士生140余名、硕士生1700余名、本科生3000余名。学院设有管理科学与工程博士后流动站一个，具有系统科学和管理科学与工程一级学科博士学位授予权。

学院拥有管理科学与工程、应用经济学、系统科学、公共管理等7个一级学科硕士学位授予权。此外，学院还有工商管理硕士（MBA）、公共管理硕士（MPA）、会计硕士（MPAcc）、工业工程、项目管理等9个专业硕士学位授予权。学院下设十个系，即工业工程系、公共管理系、工商管理系、信息管理与信息系统系、系统科学系、交通系统工程系、金融系、财政税务系、会计系、国际贸易系，以及专业学位教育中心。

管理学院与美国北达科他大学开展本科合作办学项目，与瑞典布鲁斯大学开展本科双学位合作办学项目，与美国新泽西州立罗格斯肯顿商学院、法国布雷斯特商学院、德国欧洲应用科技大学等高校开展本科合作培养项目。学院拥有1个国家批准的国际合作办学项目：工商管理（中美合作）。