学校现有博士后科研流动站4个，分别是“动力工程及工程热物理”“管理科学与工程”“光学工程”和“生物医学工程”。
“动力工程及工程热物理”博士后流动站成立于1991年，“动力工程及工程热物理”一级博士点覆盖工程热物理、热能工程、动力机械与工程、流体机械及工程、制冷及低温技术、化工过程机械等6个二级学科博士点，涵盖相应学科领域及研究方向，现有34名博士生导师。
“管理科学与工程”成立于2003年，“管理科学与工程”一级学科博士点涵盖系统工程与管理科学、交通与物流工程、工业工程与先进制造、科技管理、管理工程与企业管理、金融系统工程、教育系统工程、信息管理等学科领域及研究方向，现有33名博士生导师。
“光学工程”成立于2007年，“光学工程”一级学科博士点涵盖光电子技术、光电检测技术、光学仪器、光纤通讯技术、生物医学光学与视觉光学、印刷光学工程、微光机电系统等学科领域及研究方向，现有30名博士生导师。
“生物医学工程”成立于2014年，“生物医学工程”一级学科博士点覆盖微创医疗器械及技术、低温生物医学工程、生物医学信息及处理、生物医学光学等四个二级学科博士点，涵盖相应学科领域及研究方向，流动站现有23名博士生导师。
